SARS-CoV-2의 변이체 감시는 효과적 관리와 제어를 위해 신속한 현장 유형화 방법이 중요합니다. 본 연구에서는 내측 프라이머 없이 스웜 프라이머를 추가하여 SARS-CoV-2 오미크론 변이체를 구별할 수 있는 스마트 단일 루프 매개 등온 증폭 (ssLAMP) 방법을 개발했습니다. 이 독특한 프라이머 설계 전략은 단일 염기 다형성(SNP) 식별 프로브를 도입하는 데 더 큰 유연성을 제공하고 BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 및 BA.5를 포함한 SARS-CoV-2 오미크론 변이체의 다양한 탐지 검사를 가능하게 합니다. 3D 프린팅된 휴대용 이중 형광 시각화 기기와 스마트폰 앱을 개발하여 현장 진단 검사를 수행할 수 있습니다. 이 분석은 신속(90분 이내)하며 높은 민감도(100 복사본/반응)와 SARS-CoV-2 오미크론 변이체에 대한 특이적 식별(SNP 식별) 성능을 가지고 있습니다. ssLAMP 방법은 클리닉의 97개의 비인두 면봉 샘플 중 BA.5 양성 샘플 5개를 Sanger 시퀀싱과의 100% 일치율로 식별합니다. ssLAMP 분석 시스템은 SARS-CoV-2 및 그 변이체의 현장, 고특이적, 신속 시각화 탐지에 사용할 수 있을 것으로 기대되며, 병원체 유전자형 분석, 초기 암 선별 및 기타 SNP 돌연변이 탐지 분야에서 큰 응용 잠재력을 가지고 있습니다.
Key Points
- 스마트 단일 루프 매개 등온 증폭 (ssLAMP) 방법은 내측 프라이머 없이 스웜 프라이머를 추가하여 SARS-CoV-2 오미크론 변이체를 효과적으로 구별합니다.
- 3D 프린팅된 휴대용 이중 형광 시각화 기기와 스마트폰 앱을 사용하여 90분 이내에 신속한 현장 진단 검사를 수행할 수 있습니다.
- ssLAMP 분석 시스템은 Sanger 시퀀싱과의 100% 일치율로 SARS-CoV-2 오미크론 변이체의 BA.5 양성 샘플을 97개의 샘플 중 5개 식별하며, 현장 진단, 초기 암선별 등에 활용될 수 있는 큰 잠재력을 가지고 있습니다.