단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)은 개별 세포 내에서 전사체 전체의 유전자 발현을 연구할 수 있는 능력 덕분에 세포 정체성과 기능에 대한 이해를 혁신적으로 변화시켰습니다. 다중 조직 scRNA-seq 아틀라스는 신체 전체의 세포 역학에 대한 전체적인 이해를 생성하고 다양한 종의 추가 과학 연구를 위한 핵심 기초 자원으로 작용합니다. 돼지는 가치 있는 생물 의학 모델이고 돼지고기는 필수적인 글로벌 식량원이지만 해부학적 위치에 따른 면역 세포의 정체성과 기능에 대한 이해 부족은 농업 및 건강 발전을 제한합니다. 현재의 한계를 해결하기 위해 우리는 주요 면역 조직(뼈의 골수 및 흉선)과 이차 림프 기관(림프절 및 비장)에서 회수한 면역 세포의 아틀라스를 만들기 위해 scRNA-seq을 적용했습니다. 흉선 데이터는 이전에 발표된 돼지 흉선의 scRNA-seq 데이터셋과 비교되어 일반적인 합의를 공유하면서 새로운 흉선 세포 군집을 여러 개 식별했습니다. 비장을 인간의 비장 scRNA-seq 데이터셋과 비교한 결과, 돼지와 인간 간의 보존된 특징을 포함하여 두 가지 본래의 림프 세포 부분 집합이 유지되는 것을 밝혀냈습니다. scRNA-seq 데이터에서 림프절 세포 간 상호작용 및 근접성 추론은 일부 여포 조직 구성 및 관습적인 종자 중심 반응 과정을 유사하게 보였습니다. 생물학적 질의를 위한 scRNA-seq 아틀라스의 접근성을 확대하기 위해 우리는 대화형 애플리케이션을 개발하고 이를 사용하여 골수로부터 회수된 다양한 세포 군집에 대한 비계산 탐사를 시연합니다. 전반적으로 결과는 돼지 림프 기관의 면역 세포 정체성과 기능에 대한 현재의 기초적인 이해를 확장하고 미래 연구 응용을 위해 고려해야 할 돼지-인간 면역 유사성을 보여줍니다. 이 작업과 관련된 자료는 돼지 면역에 대한 기초 지식을 요구하는 개별 질의를 조사하기 위해 쉽게 접근할 수 있습니다.