나노바디는 식품 안전성 바이오센서의 유망한 인식 요소이지만, 그 구조 동역학과 리간드 결합 간의 관계는 잘 이해되지 않고 있습니다. 본 연구에서는 오크라톡신 A (OTA) 감지를 위한 나노바디 기반 탐지 시스템의 공학을 안내하기 위해 구조 동역학-기능 관계를 해명하는 통합 계산 및 실험적 프레임워크를 제시합니다. 반OTA 나노바디 NB28을 사용하여 리간드 인식 메커니즘을 조사하기 위해 분자 동역학 시뮬레이션, 이온 이동도-질량 분석법, 충돌 유도 펼침 체계를 사용하였습니다. NB28은 터널형 메커니즘을 통해 OTA에 결합하여 확장된 상태로의 뚜렷한 구조 변화를 유도하며, 이는 충돌 단면적 측정 및 펼침 프로파일을 통해 실험적으로 검증되었습니다. 이러한 동적 통찰력을 활용하여, 우리는 IC50 값을 줄이면서도 특이성을 유지하며 감지 민감도를 약 1.8배 향상시키는 T80C 변이를 개발했습니다. T80C는 곡물 매트릭스 전반에서 견고한 성능을 보였으며, EU 규제 기준인 5 μg/kg 이하의 감지 한계를 달성했습니다. 이 동역학 기반 접근법은 식품 안전성 바이오센서 개발을 위한 일반적인 전략을 제공합니다.