돼지 산업은 항생제 잔류물이 포함된 다량의 유기 폐기물을 생성하며, 이러한 환경적 위험을 줄이기 위해 효율적인 분뇨 관리가 필요합니다. 덮힌 석호 바이오 다이제스터(CLB)와 오수 안정화 연못(WSP)은 일반적으로 사용되는 소화 시스템이며, 이들로부터 나온 소화액은 유기 비료로 사용됩니다. 이 시스템들은 병원성 박테리아를 줄이는 데 성공했지만, 항생제 내성 유전자(ARGs) 제거에 대한 효율성은 불확실합니다. 본 연구에서는 생소형 샷건 메타게놈 시퀀싱을 사용하여 원시 및 소화된 분뇨, 비료 처리 및 비처리 토양에서의 미생물군 및 저항체 프로필을 비교했습니다. 연구 결과, 소화액 적용이 토양 미생물 군집을 약간 변화시키고 박테리아 다양성을 상당히 증가시키며, 이는 다양한 분뇨 유래 박테리아의 도입을 시사합니다. 중요 병원체와 관련된 계통적 표지자들의 읽기가 소화액과 비료 처리된 토양에서 여전히 검출되었으며, 소화 시스템에 상관없이 에르테로박테롤, 그룹 A 및 B 연쇄상구균, 엔테로코커스 패시움, 황색포도상구균, 녹농균, 아시네토박터 바우마니, 크렙시엘라 폐렴, 살모넬라 엔테리카 등이 포함됩니다. 게다가, 카바페넴, 세팔로스포린, 글리코펩타이드 등 중요한 항생제에 대한 ARG와 관련된 DNA 서열이 지속되었습니다. 특히, WSP는 OXA-347 및 vanG를 포함한 일부 ARG의 축적이 더 크게 나타났습니다. 전반적으로, CLB는 WSP에 비해 토양 미생물 군집과 저항체에 적은 영향을 미쳤지만, 어느 시스템도 ARG를 효과적으로 제거하지 못했습니다. 이러한 결과는 분뇨 비료화를 통해 환경으로의 ARG 확산 가능성을 강조하며, 돼지 산업에서 비치료적 항생제 사용 제거 등 지속 가능한 생산 방식으로의 긴급한 전환, 개선된 소화 기술 및 One Health 프레임워크 하의 지속 가능한 모니터링 필요성을 시사합니다.