돼지 폐기물을 유기 비료로 사용하는 것은 지속 가능한 농업에서 중요한 관행입니다. 본 연구는 두 가지 일반적인 돼지 폐기물 처리 시스템인 덮개형 라군 바이오다이제스터(CLB)와 폐기물 안정화 연못(WSP)이 토양의 균류 군집 구조에 미치는 영향을 평가하는 것을 목표로 합니다. 토양 및 폐기물 샘플은 서로 다른 기후, 토양 유형 및 식생을 가진 브라질 내 5개 주의 돼지 농장에서 수집되었습니다. 메타게놈 접근법을 사용하여 샘플 내의 균류 군집을 분석했습니다. 우리의 결과는 돼지 폐기물로 비료를 사용해도 균류 군집의 전반적인 다양성에는 큰 영향을 미치지 않지만, 비료를 사용한 토양과 사용하지 않은 토양 간에 군집 구성에서 현저한 변화가 관찰되었음을 보여줍니다. 특히, 폐기물 안정화 연못에서 수집된 샘플에서만 Sugiyamaella lignohabitans가 발견되어 이 환경이 리그노셀룰로스 분해와 관련된 균류의 조세를 선호할 수 있음을 시사합니다. 또한, Fusarium과 Rhizophagus라는 균류 속은 비료화에 따라 상반된 반응을 보였으며, Fusarium은 비료를 사용한 토양에서 더 풍부하게 발견되고 Rhizophagus는 감소했습니다. 균류 군집 구성의 지리적 변동도 관찰되었으며, 이는 토양의 물리화학적 특성과 상관관계가 있었습니다. 이러한 발견은 폐기물 샘플의 균류 다양성에는 폐기물 처리 시스템이 거의 영향을 미치지 않았지만, 돼지 폐기물로 토양에 비료를 사용하는 것은 특정한 분류학적 구조 측면에서 균류 군집 구성을 현저하게 변화시켰음을 나타냅니다.