돼지 생식기 및 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 주요 면역억제 병원체로, 전 세계 돼지 산업에 상당한 경제적 손실을 안깁니다. PRRSV 병원성에 대한 광범위한 연구에도 불구하고, PRRSV가 생체 내에서 면역 기능 장애를 유도하는 메커니즘은 여전히 완전히 이해되지 않았습니다. 이 연구에서는 PRRSV에 감염된 자돈의 폐에서 분리한 세포에 대해 단일 세포 RNA 시퀀싱을 수행하여 15가지 주요 세포 유형을 포함한 46,922개의 단일 세포의 전사체 프로파일을 생성하였습니다. 폐 조직에서 대식세포의 수가 상당히 감소한 것을 관찰하였는데, 이는 주로 PRRSV 감염으로 인한 대식세포의 광범위한 세포 자멸사에 기인합니다. PRRSV 감염은 대식세포의 비정상적인 분화를 유발하며, SPP1high 대식세포 하위 집단이 PRRSV 감염의 주요 표적 세포로 식별되었습니다. 세포 간 상호작용 분석을 통해 PRRSV 감염이 대식세포와 다른 세포 유형 간의 리간드-수용체 상호작용을 강화하여 염증 반응, T 세포 및 B 세포의 활성화, 세포 접착과 연관됨을 밝혔습니다. 추가로, 단핵구가 대식세포로 분화하려는 경향을 보여 PRRSV 감염으로 인한 대식세포 감소를 보상할 가능성이 있었습니다. 또한, PRRSV 감염은 B 세포의 비정상적인 발달과 폐에서의 세포 독성 T 림프구의 불완전한 활성화를 초래하였습니다. 이 연구는 PRRSV가 폐 면역 세포 집단에 어떻게 영향을 미치는지를 종합적으로 밝히며, PRRSV 유도 폐 손상에 대한 메커니즘을 이해하는데 귀중한 통찰력을 제공합니다.중요성돼지 생식기 및 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 돼지 산업에 지속적으로 중요한 위협을 가하고 있습니다. 그러나 생체 내 감염 시 바이러스-숙주 상호작용은 거의 이해되지 않았습니다. 이 연구에서 우리는 PRRSV에 감염된 자돈의 폐 조직의 세포 이질성을 특징짓기 위해 단일 세포 RNA 시퀀싱을 적용하였습니다. 세포 내 바이러스 RNA 추적을 통해 SPP1high 대식세포가 PRRSV의 주요 저장소임을 확인했습니다. 또한, 대식세포와 다른 세포 유형 간의 세포 간 상호작용을 분석하고 PRRSV 감염 시 단핵구, T 세포 및 B 세포의 면역 반응 및 이질성을 조사했습니다. 우리의 발견은 PRRSV 감염 동안 복잡한 숙주-병원체 상호작용의 포괄적인 단일 세포 지형을 제공합니다.