플라비비리다이과에 속하는 페스티바이러스 속의 구성원들은 경제적으로 중요한 가축 병원체인 고전적 돼지열병 바이러스(CSFV)와 소 바이러스성 설사 바이러스(BVDV)를 포함하고 있습니다. 최근 몇 년간의 집중적인 연구는 최소 11개의 인정된 종과 8개의 제안된 페스티바이러스 종이 존재하고 있음을 밝혔습니다. 단일 가닥의 양성 감각 RNA 게놈은 큰 폴리프로테인을 암호화하며, 이는 바이러스 및 세포 유래 프로테아제에 의해 12개의 성숙한 단백질로 처리됩니다. 단백질 코딩 기능 외에, RNA 게놈에는 바이러스 생애 주기의 다양한 단계에서 중요한 RNA 이차 구조도 포함되어 있습니다. 내부 리보솜 진입 부위(IRES)와 게놈 복제에 필수적인 3' 스템-루프와 같은 일부 RNA 이차 구조는 이미 몇몇 개별 페스티바이러스에서 연구되었습니다. 본 연구에서는 인정된 종과 제안된 종을 포함한 모든 알려진 페스티바이러스 종을 포함하는 최초의 게놈 전체 다중 서열 정렬(MSA)을 제공합니다. 또한, 전체 속에 걸쳐 계통학적으로 보존된 RNA 이차 구조에 대한 포괄적 분석을 수행했습니다. 잘 설명된 5' 스템-루프 구조, IRES 요소, 및 3' 스템 루프 SLI가 모든 페스티바이러스에서 보존되어 있는 반면, 3' 비번역 영역(UTR)의 다른 RNA 이차 구조는 일부 종의 하위 그룹에서만 보존되었습니다. 단백질 코딩 영역에서 기능적 중요성이 아직 해명되지 않은 29개의 새로운 계통학적으로 보존된 RNA 이차 구조를 확인했습니다. 이전에는 A, B, C 종에서 알려졌던 미세 RNA 결합 부위는 이번 연구에서 추가적으로 10개의 종에서 확인되었으나, K, S, Q 및 R 종에서는 확인되지 않았습니다. 또 다른 흥미로운 발견은 IRES와 게놈의 3' 말단 사이에 잠재적인 장거리 RNA 상호작용을 식별한 것입니다. 이 결과는 모든 19개의 페스티바이러스 종을 포함하는 현재 사용 가능한 포괄적 다중 서열 정렬과 함께 향후 연구와 진단 목적으로 귀중한 자료가 될 것입니다.