돼지 생식 및 호흡기 증후군(PRRS)은 PRRS 바이러스(PRRSV)에 의해 유발되며, 세계적으로 주요한 돼지 질병입니다. 이 연구는 일본에서 2020년부터 2023년까지 표준화된 오픈 리딩 프레임 5 기반 계통 분류 시스템을 사용하여 진단 자료를 통해 검출된 1207개의 PRRSV 서열을 분석했습니다. 계통 발생 분석에서는 일본에서 6개의 계통(L1, L4, L5, L8, L9, L11)이 확인되었습니다. 특히, 연구 기간 동안 L1의 유병률이 현저히 증가했습니다. L1 균주는 주로 간토와 규슈 지역에서 검출되었습니다. 간토에서는 L1B가 주로 발생했으며(80%), 반면 규슈에서는 더 다양한 하위 계통(L1A, L1B, L1E, L1I)이 관찰되었습니다. 쌍별 뉴클레오타이드 일치 분석은 L1 군집 내에서 높은 유전적 이질성(평균 일치율 90.1%)을 보여주었으나, L5와 L8 군집은 매우 동질적(각각 97.9% 및 98.3%)이었으며 상업 백신 균주와 높은 서열 일치도 (>95%)를 보였습니다. 이 연구는 글로벌 계통 시스템에 기반하여 PRRSV의 일본 전국적인 분자역학분석을 처음으로 제공하였습니다. 이 결과는 일본의 독특한 L1 하위 계통 동태 (예: L1B 우세성)가 글로벌 트렌드 (예: 미국의 L1C.5, 중국 및 한국의 NADC30/34 유사 균주)와 비교하여 PRRSV 효과적 제어 전략을 알리는 데 중요한 통찰력을 제공합니다.