돼지써코바이러스 3형 (PCV3)은 전 세계 돼지 개체군에 영향을 미치는 다양한 임상적 증상과 관련된 중요한 병원체로 대두되고 있습니다. PCV3 균주의 유병률과 분자적 특성을 조사하기 위해, 우리는 2022년 3월부터 2024년 12월까지 허난성 18개 도시에서 다양한 규모의 650개 농장에서 돼지 11,194개의 조직 샘플을 수집했습니다. PCV3 검출은 검증된 실시간 정량적 PCR 분석을 사용하여 수행되었습니다. 결과에 따르면, PCV3의 총 양성률은 9.25%(1035/11,194)였으며, 허난성의 18개 도시의 돼지 농장에서 PCV3가 검출되었습니다. 여섯 개의 PCV3 균주의 전체 게놈 서열 및 네 개의 PCV3 균주의 ORF2 유전자 서열이 결정되고 분석되었습니다. 이 10개 PCV3 균주는 ORF2에서 PCV3 참조 균주와 98%에서 99.7%의 염기 서열 일치를 보였습니다. 이 10개 PCV3 균주의 ORF2 유전자 전체 서열은 서로 98.4%에서 99.8%의 염기 서열 일치를 공유했으며, 암호화된 단백질은 98.1%에서 100%의 아미노산 서열 일치를 공유했습니다. ORF2 유전자에 기반한 계통학적 분석 결과, 10개의 시퀀싱된 PCV3 균주 모두가 PCV3b 유전자형에 속하는 것으로 나타났습니다. 주목할 만하게, 이들 균주의 Cap 단백질 내 예측된 B세포 항원 결정기에 두 개의 아미노산 돌연변이가 확인되어, 이는 PCV3의 면역원성에 영향을 미칠 수 있습니다. 이러한 데이터는 PCV3의 분자 역학과 진화에 대한 이해를 높여주며, PCV3 및 기타 PCV의 예방 및 통제를 위한 기초를 제공합니다.
Key Points
- 2022년 3월부터 2024년 12월까지 허난성 18개 도시의 650개 농장에서 11,194개의 돼지 조직 샘플을 수집하여 PCV3의 유병률을 조사했습니다.
- 검사 결과, PCV3의 총 양성률은 9.25%였으며, 여섯 개의 PCV3 균주의 전체 게놈 서열과 네 개의 ORF2 유전자 서열이 결정되었습니다.
- 10개 PCV3 균주는 ORF2 유전자에 기반한 계통학적 분석에서 모두 PCV3b 유전자형에 속하며, Cap 단백질의 예측 B세포 항원 결정기에 두 개의 아미노산 돌연변이가 발생하여 면역원성에 영향을 미칠 수 있습니다.