돼지의 장내 미생물군은 돼지 건강은 물론 생산 성능에 중요한 역할을 합니다. 그러나 여러 생물계에서의 유전체 수준의 분석은 여전히 제한적입니다. 본 연구에서는 5784개의 메타유전체 샘플을 사용하여 박테리아, 고세균을 포함한 통합 돼지 위장관 유전체(UPGG)를 재구성하고, 7800만 이상의 중복되지 않는 단백질 코딩 유전자를 주석화하였습니다. 우리는 항생제 내성 유전자(ARGs)와 이동 유전 요소(MGEs)를 식별하고, 기존 개체들 사이에서 72,056개의 대사 유전자 클러스터의 분포를 조사했습니다. 436개의 고품질 미생물 종의 판유전체를 구축하고 이를 참고로 하여 23,350,975개의 단일 염기 변이(SNVs)를 밝혀낸 종내 유전체 변이를 발견했습니다. 마지막으로, 이 연구에서 수행한 장내 미생물군 유전체의 비교 분석을 통해, 돼지가 인간 장내 미생물 구성 및 기능적 패턴을 연구할 때 다른 동물보다 더 적합한 모델이 될 수 있음을 관찰했습니다. 요약하자면, 우리는 돼지 장내 미생물군의 포괄적인 참고 카탈로그를 구축하고 숙주-미생물 공동 진화에 대한 이해를 증진했습니다.