비암호화 RNA는 다양한 세포 유형에서 다양하고 중요한 역할을 담당하며 많은 장비암호화 RNA(lincRNA)는 생식 세포 발달에 관여하는 것으로 알려져 있습니다. lncRNA는 아직 대부분이 특성화되지 않았지만, 엑스 불활성화, 다능성, 유전체 각인 및 세포 분화 등의 주요 생물학적 과정에서 필수적인 역할을 수행합니다. 본 연구에서는 Gene Expression Omnibus 저장소의 공개 접근 가능한 단일 세포 RNA 시퀀싱 데이터(scRNA-seq)를 사용하여 종합적인 생정보학적 분석을 수행했습니다. 데이터 세트는 돼지 배아 발달의 다양한 단계에서 유래한 네 가지 다른 세포 유형을 포함합니다: E11 유래 상피배세포, E14 유래 체세포 및 원시 생식 세포, E31 유래 원시 생식 세포. 우리의 분석은 많은 수의 lncRNA를 식별하고, 배아 발달에서 그들의 중요한 역할을 강조하면서 표현 패턴을 평가했습니다. 또한 lncRNA와 단백질 암호화 유전자 간의 관계를 탐구하였으며, 특히 초기 배아 발생 동안 DNA 탈메틸화에 대한 역할이 알려진 텐 일레븐 트랜스로케이션(TET) 패밀리 유전자에 초점을 맞추었습니다. 우리는 돼지 초기 배아에서 약 0.15백만 개의 lncRNA 전사체를 확인했습니다. 추가로, 다양한 세포 유형 간의 lncRNA와 단백질 암호화 유전자의 차별화된 발현 프로필을 조사하여 배아가 분화하면서 유사점과 차이점을 관찰했습니다. 마지막으로, 공동 발현된 TET 패밀리 유전자와 차별화된 lncRNA 간의 잠재적 상호작용을 예측하기 위해 LncTar를 사용하여 초기 배아 발달에서의 기능적 관계에 대한 추가 통찰력을 제공했습니다.