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무질서 영역의 구조적 유연성이 전사 인자 AflR의 다양한 서열 DNA 인식을 가능하게 한다

2025-10-07 14:39 | 추천 : 0 | 댓글 : 0
전사 인자가 다양한 DNA 서열을 인식하면서 결합 특이성을 유지하는 능력은 유전자 조절에 필수적이지만, 이 유연성을 가능하게 하는 분자적 메커니즘은 아직 잘 이해되지 않고 있습니다. 본 연구에서는 전사 인자 AflR의 DNA 결합 도메인이 구조화된 아연 클러스터 모티프와 무질서한 말단 영역을 사용하여 다양한 서열의 DNA를 인식하는 방식을 보여줍니다. NMR 분광법, 분자역학 시뮬레이션 및 생화학적 접근 방법을 사용하여 AflR의 DNA 결합 도메인이 동적 말단 영역을 가진 구조화된 아연 클러스터 코어를 포함하고 있음을 입증하였습니다. AflR DNA 결합 도메인 모노머 두 개는 역 CG 반부위를 인식하며, 아연 클러스터 모티프가 서열 특이적 고정점을 제공하고, 동적 말단이 분산된 상호 작용을 통해 결합을 최적화합니다. DNA 결합이 전체적인 안정화를 유도하지만, 말단 영역은 결합 상태에서도 구조적 유연성을 유지하여 서열 변이에 적응할 수 있습니다. 아연 클러스터와 C-말단 잔기 돌연변이는 복합체의 안정성을 크게 방해합니다. 특히, C-말단 영역은 다양한 표적 서열과의 안정한 복합체 형성에 필요한 구조적 변화를 조정하는 구조적 중심 기능을 합니다. 본 연구는 고유의 무질서가 전사 인자의 다양한 서열 인식을 가능하게 하면서 특이성을 유지하는 방식을 보여주어, 다중 표적 유전자 조절의 분자적 기초에 대한 통찰력을 제공합니다.
Key Points
  • AflR의 DNA 결합 도메인은 구조화된 아연 클러스터와 동적 말단 영역을 결합하여 다양한 서열의 안정을 도모합니다.
  • 아연 클러스터 모티프와 동적 말단 영역의 조합은 다양한 DNA 서열에 대한 특이적이고 안정적인 인식을 제공합니다.
  • C-말단 영역은 다양한 표적 서열과의 상호 작용을 조정하는 구조적 중심 기능을 하여 복합체 형성에 기여합니다.