이 연구는 TRIzol®로 불활성화된 샘플을 사용하여 세네카바이러스 A(SV-A)와 돼지열병 바이러스(CSFV)를 검출하기 위한 네 가지 상업용 바이러스 RNA 추출 프로토콜을 평가했다. 실험된 키트는 RNeasy®(Qiagen), IndiSpin(Indical), Aurum(BioRad), Direct-zol(Zymo)였으며, 전통적인 Tri Reagent(Sigma) 방법과 비교했다. 분석은 일상적인 실험실 환경에서의 추출의 민감도와 속도를 기반으로 진행되었다. 결과는 프로토콜을 적절하게 수정하면 검출 민감도가 증가할 수 있다는 것을 보여주었다. 임상 샘플은 서로 다른 프로토콜 변형을 사용하여 처리되었으며, 특히 RNeasy®는 GenoTube®를 사용하여 수집한 샘플에서도 뛰어난 성능을 보임으로써 현장 분자 진단의 가능성을 제시했다. 연구는 TRIzol®이 효과적임에도 불구하고 대안적인 방법들이 실용성, 짧은 추출 시간, 동등하거나 뛰어난 민감도를 제공함을 결론지었다.
Key Points
- 연구는 TRIzol®과 비교하여 바이러스 RNA 추출 프로토콜을 평가하여 세네카바이러스 A와 돼지열병 바이러스 검출 민감도를 향상시킬 수 있는 방법을 모색하였다.
- RNeasy®를 포함한 여러 키트가 실험에 사용되었으며, RNeasy®는 특히 GenoTube®를 통해 수집된 샘플에서도 탁월한 성능을 보였다.
- 대안적인 RNA 추출 방법들은 TRIzol®과 유사하거나 더 나은 민감도를 제공하며, 추출 시간 단축과 실용성 면에서도 우수함을 확인하였다.