돼지 생식 및 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 세계 돼지고기 산업에 심각한 영향을 미치는 주요하고 매우 전염성이 높은 돼지 병원체입니다. 일반적으로, 돼지에서 분리된 돼지 폐포 대식세포(PAM)를 PRRSV에 감염시켜 바이러스 병인 분석에 사용하지만, 이는 실제 생체 내 질병 과정을 정확하게 반영하는지는 명확하지 않습니다. 이 연구에서 scRNA-seq 분석은 배양된 대식세포와 신선히 분리된 대식세포 사이의 명확한 전사적 프로파일을 밝혀냈습니다. 염증, 세포 자살, 자가포식 및 TNF 신호 경로는 생체 내 및 시험관 내 모두에서 활성화되었지만, 부분적인 GO 용어와 KEGG 경로만이 일치하였습니다. 특히, PRRSV 유전체는 생체 내 T 및 B 세포에서 검출되어 PRRSV가 T 및 B 세포 기능에 미치는 잠재적 영향을 나타냅니다. 결과는 또한 PRRSV 감염이 강력한 염증을 유발했지만 소수의 PAM만이 감염되었음을 보여주었습니다. 흥미롭게도, 관찰자 세포는 PRRSV에 감염된 세포와 유사한 염증 반응을 나타내어 관찰자 세포가 염증 반응에서 하는 역할을 암시합니다. scRNA-seq 분석을 통해 PRRSV 감염 전후 세포의 전사체 프로파일링은 여러 개의 뚜렷한 하위 클러스터(S0-S7 및 SS0-SS6)를 밝혀냈으며, S5 하위 집단이 가장 높은 PRRSV 감염률을 보였고 SS6 하위 집단은 가장 빠른 PRRSV 복제율을 나타냈습니다. SLAMF7 유전자는 PRRSV에 감염된 이 두 하위 집단에서 핵심 유전자로 나타났습니다. SLAMF7의 발현 억제는 PRRSV 감염을 크게 줄이고 PRRSV로 인한 염증을 억제하는 반면, 과발현은 PRRSV 복제와 PRRSV로 인한 염증을 촉진하였습니다.