가금류의 난생산은 여러 생리적 시스템의 얽힌 작용에 의해 형성되어, 그 기저에 있는 유전적 조절의 복잡성을 크게 증대시킵니다. 조절 변이의 다중 조직 매핑은 이 복잡성을 푸는 강력한 경로를 제공하지만, 오리에 대한 포괄적인 데이터 세트는 아직 부족합니다. 한편, 가금류 난생산에 대한 신경내분비 규제를 넘어서는 주변 시스템의 기여는 여전히 크게 탐구되지 않았습니다. 이 연구에서는 간, 난소, 난관 껍데기 샘, 그리고 비장에서 979개의 RNA-seq 샘플과 307마리 산란 오리의 전체 유전체 시퀀싱 데이터를 생성했습니다. 유전자 발현(eQTL), 대체 스플라이싱(sQTL), 그리고 3' 대안 폴리아데닐화(apaQTL)에 관련된 시스-조절 변이를 매핑하여 각각 14,074, 6,267, 그리고 4,994개의 유전자가 최소 하나의 중요한 eQTL, sQTL, 그리고 apaQTL을 갖도록 했습니다. 이 자원과 GWAS 결과를 통합하여, 껍데기 샘에서 ABCG2 발현이 알껍데기 색을 구체적으로 조절하며, 추가적으로 껍데기 샘과 간의 ENOPH1의 3'APA 사이트가 관련됨을 확인했습니다. 또한, 껍데기 샘에서 LOC101800576 및 LOC101790890의 발현, 난소에서 LOC119713219의 발현, 비장에서 GLP2R의 발현이 산란 최대기에서 난생산 감소와 인과적으로 연결되어 있음을 밝혔습니다. 마지막으로, 오리 난생산의 배후에 있는 교차 조직 조절 경관을 구체적으로 밝히고 간 유래 모듈, 특히 주로 세포 주기 조절에 관여하는 Liver_ME1이 주변 조직과 협력하여 오리 난생산에 영향을 미치는 중심 허브임을 확인했습니다. 이 연구는 오리 난생산 유전적 메커니즘 해부를 위한 주요 자원과 새로운 관점을 제공하며, 생식의 교차 조직 조절에 대한 향후 연구에도 기여할 것입니다.
Key Points
- 두뇌내분비 시스템 외의 주변 시스템이 오리 난생산에 미치는 영향은 미지의 분야로, 이 연구는 간, 난소, 난관 껍데기 샘, 비장에서 총 979개의 RNA-seq 샘플을 생성하여 이 부분을 연구합니다.
- 종합적인 조절 변이를 매핑하여 수천 개의 유전자와 관련된 다양한 효과를 밝혀내고, 알꽤기 색을 조절하는 ABCG2 발현과 다른 유전자 발현이 난생산에 미치는 영향을 확인합니다.
- 간 유래 모듈, 특히 Liver_ME1이 세포 주기 조절을 중심으로 하여 주변 조직과의 조정력을 가지고 오리 난생산에 주요 역할을 한다고 밝혀, 다중 조직 간 협력이 난생산에 중요한 영향을 미침을 강조합니다.