샘플 풀링은 풍토성 병원체의 효율적이고 비용 효율적인 감시를 가능하게 하여 더 광범위한 테스트 범위 및 진단 비용 절감을 가능하게 합니다. 인플루엔자 A 바이러스 감시를 위한 돼지 샘플 풀링이 민감도에 부정적인 영향을 미치지 않으려면 샘플 유형, 사이클 임계값 (Ct값), 희석 수준에 따라 달라집니다. 따라서 본 연구는 풍토성 돼지 번식군으로부터 얻은 가족 구강액, 유방 닦기, 비강 닦기에서 다양한 풀링 수준에서 IAV 역전사 실시간 중합효소 연쇄 반응(RT-rtPCR)의 검출 확률을 비교하는 것을 목적으로 하였습니다. IAV 양성 군으로부터 얻은 45개의 IAV RT-rtPCR 양성 샘플 (가족 구강액 15개, 유방 닦기 15개, 비강 닦기 15개)을 다양한 수준 (미희석, 1/3, 1/5, 1/10)으로 풀링하였습니다. 분석을 위해 샘플은 미희석 복제 샘플의 평균 Ct값을 기준으로 세 그룹으로 분류되었습니다: A 카테고리 - Ct <30; B 카테고리 - Ct 30에서 34 사이; C 카테고리 - Ct > 34-38 사이. 모든 샘플 유형에서, Ct A 카테고리 및 Ct B 카테고리의 가족 구강액 및 유방 닦기에서 인플루엔자 A 바이러스 RNA 검출 확률은 희석 수준이 1/10으로 증가해도 감소하지 않았습니다. 모든 샘플 유형의 카테고리 C에서는 희석 수준이 증가함에 따라 인플루엔자 A 바이러스 검출 확률이 감소했습니다. 이러한 결과는 Ct 값이 34 미만인 샘플을 다룰 때 인구 기반 샘플을 풀링하는 것이 돼지 감시를 위한 효과적인 전략일 수 있음을 시사하며, 현장 적용을 위한 권장 사항을 개선하기 위해 현장 연구가 필요합니다.
Key Points
- 샘플 풀링은 돼지 번식군에서 인플루엔자 A 바이러스 감시에 있어 효과적이며 비용 효율적인 방법으로 사용할 수 있습니다.
- Ct 값이 34 미만인 샘플을 사용할 때, 희석 수준이 1/10까지 증가해도 바이러스 RNA 검출 확률은 감소하지 않았습니다.
- Ct 값이 34 이상인 샘플에서는 희석 수준이 증가함에 따라 인플루엔자 A 바이러스 검출 확률이 감소했습니다. 이는 향후 권장 사항을 개선하기 위해 추가 연구가 필요함을 시사합니다.