돼지 생식기 및 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 양돈 산업에 막대한 경제적 손실을 초래했지만 효과적인 항바이러스 약물은 없습니다. 핵산(N) 단백질은 2형 PRRSV에서 매우 보존되어 있으며 항바이러스 개발의 중요한 표적으로 간주됩니다. 미니 바이더는 특정 단백질 표적을 위해 de novo로 설계된 혁신적인 단백질 약물로, 컴퓨터 접근법을 사용하여 설계되며 큰 응용 가능성을 가지고 있습니다. 여기서 우리는 Rosetta 기반 접근법을 사용하여 2형 PRRSV N 단백질의 캡시드 형성 도메인을 표적으로 하는 미니 바이더를 설계했습니다. 표적 단백질의 소수성 표면이 결합 부위로 선택되었고, 유망한 결합 모드가 광범위하게 탐색되었습니다. 분자량이 약 6 kDa인 세 가지 고열안정성 미니 바이더가 확인되었습니다. 모든 바이더는 세포막을 관통하여 세포질에 분포할 수 있습니다. 그 중 바이더 2는 in vitro에서 강력한 항-PRRSV 효능을 보여주었으며, 바이러스의 진입, 내부화 또는 방출에 간섭하지 않으면서 바이러스 복제를 강력하게 억제했습니다. BLI 분석 및 BiFC 분석을 통해 바이더 2와 PRRSV N 단백질의 캡시드 형성 도메인 간의 결합이 확인되어 항바이러스 메커니즘이 예상과 일치함을 나타냈습니다. 본 연구는 새로운 항-PRRSV 제제를 개발하는 데 새로운 통찰력을 제공합니다.
Key Points
- Rosetta 기반 기술을 활용하여 2형 PRRSV 핵산 단백질의 캡시드 형성 도메인을 표적으로 하는 미니 바이더를 설계했습니다.
- 고열안정성을 가진 분자량 약 6 kDa의 세 가지 미니 바이더가 확인되었으며, 이들은 모두 세포막을 관통하여 세포질에 분포합니다.
- 바이더 2는 바이러스의 진입, 내부화 또는 방출에 간섭하지 않고 in vitro에서 바이러스 복제를 억제하는 강력한 항-PRRSV 효능을 보여주었습니다.