인플루엔자 A 바이러스(IAV)는 돼지에서 가장 자주 검출되는 호흡기 병원체 중 하나입니다. 미국(미국)의 수동 감시 시스템은 유전적 다양성의 공간 및 시간적 변화를 정량화하기 위한 집계 지표를 제공합니다. 그러나 돼지 생산은 균일하지 않으며, 생산 시스템은 IAV 전파와 진화에 영향을 미치는 크기와 관리 전략이 다양합니다. 미세한 규모의 변동이 IAV 전파에 어떻게 영향을 미치는지를 평가하기 위해, 우리는 4개의 미국 생산 흐름에서 최대 14개월 동안 번식용 농장과 연결된 육묘장에서 능동 감시를 수행했습니다. 85개의 완전한 HA 염기서열과 62개의 전체 게놈이 관련된 역학 정보와 함께 생성되었습니다. 우리는 계통역학 분석을 수행하여 4개의 HA 계통에서 6개 유전적 계통을 검출했습니다: H1 1A 고전적 돼지, H1 1B 인간-계절성, H3 2010.1 및 1990.4. H1 1B 및 H3 1990.4는 번식용 농장에서 육묘장으로의 전파 증거를 보였습니다. H1 1A 및 H3 2010.1 바이러스는 연결된 번식용 농장 검출 없이 육묘장에서 검출되었습니다. 번식용 농장과 육묘장에서 H1N1 팬데믹 계통(1A.3.3.2)에서 7개의 별도 인간-돼지 전파 사건이 확인되었습니다. 육묘장은 번식용 농장과 연결되고 연결되지 않은 IAV에 감염되었습니다. 통제 노력은 번식용 군에서의 무증상 IAV 전파, 육묘장에서 번식용 농장 자원의 혼합, 새로운 변종의 지역적 확산 및 인간-돼지 전파로 인해 영향을 받을 수 있습니다. 생산 시스템 내 정기적인 감시 활동은 백신 구성요소를 순환하는 다양성에 맞출 수 있는 능력을 제공하여, 새로운 재조합 바이러스가 출현하여 동물 건강에 영향을 미칠 기회를 최소화합니다.