이 체계적 검토는 돼지 폐수 처리 시스템에서 항균제 내성 유전자(ARGs)를 감지하기 위해 사용되는 메타유전체 방법론적 접근을 식별하는 것을 목적으로 합니다. 검색어로는 메타유전체 AND 세균 AND ('항균제 내성 유전자' OR 내성체 OR ARG) AND 폐수 AND (돼지 OR 돼지)를 활용하였으며, 검색은 PubMed, Scopus, ScienceDirect, Web of Science, Embase, Cochrane Library와 같은 전자 데이터베이스에서 수행되었습니다. 검색은 2020년부터 2024년까지 발표된 연구로 제한되었습니다. 검색을 통해 수집된 220개의 연구 중 8개가 전체 텍스트 분석을 위한 기준을 충족했습니다. 이 연구 분야의 출판물 수는 최근 몇 년간 증가했으며, 중국이 가장 많은 연구를 기여하였습니다. ARGs는 일반적으로 품질 트리밍, 조립, 메타유전체 조립된 게놈(MAG) 재구성, 열린 읽기 틀(ORF) 예측 및 ARG 주석 등의 단계를 포함하는 생정보학적 파이프라인을 사용하여 식별됩니다. 그러나 연구 전반에 걸쳐 ARGs 정량화를 비교하는 것은 방법론적 차이와 변동성 때문에 여전히 도전적입니다. 따라서 이 체계적 검토는 비교를 용이하게 하고 메타유전체 접근법을 통해 돼지 폐수 처리 시스템에서의 항균제 내성에 대한 이해를 강화하기 위해 방법론의 표준화가 필요하다는 점을 강조합니다.