돼지 생식기호흡기증후군 바이러스(PRRSV)는 특히 SRCR5 도메인을 통해 CD163 수용체를 타겟으로 하여 돼지 산업에 심각한 경제적 손실을 초래합니다. 그러나 이 인터페이스에서의 소분자의 억제 작용에 대한 분자 수준의 세부 사항은 명확하지 않습니다. 여기에서 우리는 PRRSV/CD163-IN-1(B7) 화합물이 어떻게 CD163-SRCR5를 차단하는지에 대한 최초의 기전적 인사이트를 제공합니다. 구조적 정제, 분자 동역학(MD) 시뮬레이션, 앙상블 도킹 및 단편 분자 궤도(FMO) 계산을 사용하여 B7/CD163-SRCR5 결합 형태를 확인했습니다. 결정 구조는 형태적 유연성을 나타내는 데 한계가 있기 때문에, 소분자 재활용 라이브러리의 효율적인 가상 스크리닝을 촉진하기 위해 CD163-SRCR5의 MD 정제 모델을 제안했습니다. 인 실리코 분석을 통해 백최선 후보로 부상했으며, 이는 이전 실험적 증거와 일치합니다. 이 결과는 바이칼린의 항바이러스 활성 지지를 제공하여 리드 화합물로서의 잠재력을 강화합니다. 본 연구는 CD163-SRCR5에서의 리간드 인식에 대한 분자적 기초와 PRRSV 진입 억제제를 설계하기 위한 틀을 제공합니다.
Key Points
- PRRSV는 CD163 수용체의 SRCR5 도메인을 통해 돼지 폐포 대식세포를 표적으로 하여 경제적 손실을 유발합니다.
- 본 연구는 PRRSV/CD163-IN-1이 CD163-SRCR5를 차단하는 기전적 통찰을 최초로 제공합니다.
- 백침이 인 실리코 분석을 통해 유망한 리드 화합물로 확인되었으며, 이는 바이칼린의 항바이러스 활성에 대한 추가 증거를 제공합니다.