부드러운 진드기과(Argasidae)는 의학 및 수의학적으로 중요한 매개체를 포함하고 있지만, 경성진드기(Ixodidae)와 비교했을 때 분자 자원이 거의 없습니다. 그 예로는 인간 회귀열의 원인인 Borrelia turicatae의 매개체로 알려져 있으며, 아프리카돼지열병 바이러스의 추정 매개체인 Ornithodoros turicata가 있습니다. Argasidae의 현재 분자 자원 부족 문제를 해결하기 위해 우리는 PacBio 시퀀싱과 Illumina Hi-C 라이브러리를 결합하여 O. turicata의 염색체 수준 유전체 조립을 생성했습니다. 결과적으로 총 길이 1.1 Gb의 참조 유전체가 생성되었으며, 10개의 염색체와 368개의 위치가 확정되지 않은 스캐폴드로 조립되었고, N50은 2.7 Mb이며 QV 점수는 43.58입니다. 상동 분석에 따르면, 97.8%의 BUSCO 완전성 점수와 36,149개의 주석이 달린 유전자와 함께 고품질로 평가되었습니다. 유전체의 33%는 반복 요소로 식별되어 마스킹되었습니다. 첫 번째 부드러운 진드기 참조 유전체의 생성은 향후 연구에서 유전체 도구를 사용하여 매개체 감염성 질병 관리를 지원할 수 있는 기반을 마련합니다.
Key Points
- Argasidae과의 현재 분자 자원 부족을 해결하기 위해 Ornithodoros turicata의 염색체 수준 유전체 조립이 이루어졌습니다.
- PacBio 시퀀싱과 Illumina Hi-C 라이브러리가 결합해 총 1.1 Gb의 참조 유전체가 10개의 염색체와 368개의 미 배치 스캐폴드로 조립되었습니다.
- 유전체의 완성도를 평가하는 BUSCO에서 97.8%의 완전성을 기록하였고, 이는 향후 연구에서 매개체 감염병 관리를 위한 유전체 툴의 활용을 지원할 것입니다.