돼지생식호흡기증후군 바이러스 (PRRSV)는 돼지 생산에 있어 여전히 주요한 문제로 남아 있습니다. 본 연구는 2018년부터 2024년 사이 대만 내 1계통 및 3계통 PRRSV-2의 분자 역학을 조사합니다. 대만의 15개 군에서 총 43,977개의 샘플이 수집되었고, 이 중 13,611개가 실시간 PCR 검사를 통해 PRRSV 양성 판정을 받았습니다. 이 중 501개의 완전한 ORF5 서열이 확인 및 분석되었습니다. 확인된 PRRSV-2 서열은 1계통 (특히 최소한 Clade A, Clade B, 그리고 Clade C로 나눌 수 있는 아계통 L1A; 117/501, 23.4%) 또는 3계통 (384/501, 76.6%)에 속하였습니다. 놀랍게도 1계통 PRRSV-2 서열 중 117개 중 103개 (88.0%)는 모돈 관련 표본에서 발견된 반면, 14개 (12.0%)는 자돈 관련 표본에서 발견되었습니다. 계통지리학적 데이터는 중앙 및 남부 대만 간의 다중 양방향 전파가 있었음을 보였으며, 이후 북부 및 동부 지역으로 확산되었습니다. 이는 1계통 PRRSV-2가 모돈에서 높은 사망률과 유산율을 유발하고 대만 전역으로 퍼졌음을 시사합니다. 본 연구는 2018-2024년 동안 대만 내 외래 1계통 PRRSV-2 균주의 현재 전염 상황과 확산을 처음으로 설명합니다.