과일과 채소와 같은 식품의 대변 오염은 여전히 주요한 공중보건 문제로 남아 있습니다. 미국 질병통제예방센터(CDC)는 매년 4,800만 명이 식품 유래 질병에 걸린다고 추정합니다. 농산물의 품질은 대변 또는 생장, 수확 및 유통에 영향을 미칠 수 있는 환경 요인에서 오는 병원체에 의해 영향을 받습니다. 따라서 오염원을 식별하고 식품 안전 모니터링을 개선하기 위해 빠르고 신뢰성 있는 검출 방법이 필수적입니다. PCR 기반 방법은 대변 연관 미생물 마커인 Bacteroides 또는 기타 숙주 연관 대상을 포함한 식품 샘플에서의 세균 DNA 검출을 위한 민감하고 구체적인 접근법을 제공합니다. 이 연구의 목표는 디지털 PCR을 이용하여 농산물(딸기)의 대변(Bacteroides) 오염을 검출하고, 이를 표준 실시간 PCR 기반 방법과 비교하는 것입니다. 소, 쥐, 가금류 및 기타 동물로부터 대변 샘플이 수집되었고, 이 샘플로부터의 세균 DNA(Bacteroides)가 수집 및 분석되었으며, 결과로 얻어진 절차는 샘플 내 세균의 페미토그램 수준을 검출할 수 있었습니다. 대변 오염의 출처를 판별하기 위해, 단일 또는 다중 PCR을 사용하여 여러 척추동물 종에 대한 mtDNA 프라이머 및 프로브가 개발되었습니다. 이러한 분석법은 샘플의 mtDNA 농도를 10 사본/µL로 검출할 수 있도록 개발, 최적화 및 검증되었으며, 이는 농산물 대변 오염의 원천 또는 출처를 결정하는 데 유용한 절차입니다.