황색포도상구균 아종 무산소 균주(SAAN)는 소형 반추동물에서 Morel 질병으로 알려진 농양을 유발합니다. 본 연구는 독일 및 오스트리아에서 처음으로 SAAN의 존재를 설명하며, 이들 균주와 이전에 설명된 유럽 및 수단의 균주 간의 계통 유전적 관계를 조사합니다. 독일의 12개 농장에서 35마리의 양과 10마리의 염소에서 분리된 균주가 분석을 위해 취합되었습니다. 네 개의 폴란드 염소와 세 개의 오스트리아 양 농장에서 SAAN 균주가 포함되었습니다. 핵심 유전체 다위치 서열 유형 분석을 사용하여 게놈 비교 및 계통 유전적 분석이 수행되었습니다. 52개 SAAN 핵심 게놈을 비교한 결과, 대부분의 독일 균주(n = 38) 간에 긴밀한 계통 유전적 관계가 나타났으며 두 개의 ST4581 관련 클러스터에서 대립 유전자 차이가 최대 6개에 불과하였습니다. 반면, 동일한 ST의 명확히 구별되는 클러스터에는 각각 네 개의 폴란드 염소 균주와 두 개의 오스트리아 양 균주가 포함되었습니다. 독일의 세 농장(양 6마리, 염소 1마리)과 한 오스트리아 양에서 ST3756 균주의 다섯 번째 클러스터가 확인되었습니다. 계통 유전적 관계는 숙주 종과 관계없이 긴밀하게 관찰되었습니다. 모든 균주는 공통적인 독력 유전자 세트를 공유하며, 몇몇 알려진 항균제 저항 결정 인자를 포함하고 있었습니다. SAAN의 농장 도입 경로는 대체로 알려지지 않았으나, 구매가 중요한 역할을 하는 것으로 보였습니다.
Key Points
- 처음으로 독일과 오스트리아에서 황색포도상구균 아종 무산소 균주(SAAN)가 발견되었습니다.
- 독일, 폴란드, 오스트리아의 소형 반추동물들에서 분리한 균주 간의 긴밀한 계통 유전적 관계가 확인되었습니다.
- 숙주 종과 관계없이 SAAN 균주는 공통적인 독력 유전자를 공유했고, 구매가 농장에 균을 도입하는 주요 경로일 가능성이 높았습니다.