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Actinobacillus pleuropneumoniae의 분자 혈청형 분류 방법 비교 및 일상 진단에서 감지된 비정형 혈청형 분석

2025-04-18 19:01 | 추천 : 0 | 댓글 : 0
Actinobacillus pleuropneumoniae (APP)에 의한 임상적 발병 및 아형 감염은 전 세계 돼지 건강에 큰 영향을 미치며, 상업용 백신이 여러 개 존재함에도 불구하고 이러한 발생이 종종 대두됩니다. 상업적으로 백신 접종을 받은 돼지 떼에서 APP 발생 시 자가 백신 프로그램이 시행됩니다. 따라서 관련 APP 혈청형의 식별 및 특성화는 예방 전략의 구현과 농장에서의 항생제 사용 감소에 매우 중요합니다. 서로 다른 방법으로 얻은 혈청형 결과를 해석하는 것은 결과가 일치하지 않거나 유형을 정할 수 없는 APP 균주가 있을 경우 어려울 수 있습니다. 이 연구에서는 캡슐 유전자에 기반을 둔 방법과 apx 독소 유전자 기반의 PCR 두 가지 일상 혈청형 방법을 151개의 APP 필드 균주 및 19개의 APP 참고 균주에 대해 비교했습니다. MALDI-TOF-MS를 통해 세균 배양 후 APP 종을 식별하고 이어서 혈청형 검사를 실시하였습니다. 독소 프로파일은 APP 필드 균주의 37 %에서 캡슐 유전자 PCR로 정의된 혈청형과 일치하지 않았으며, 이들은 (1) 비정형 캡슐 (cps) 유전자 패턴(22%)과 (2) 비정형 apxIV 독소 유전자 길이(78%)로 그룹화되었습니다. 선택된 비정형 APP 균주들은 전 유전체 시퀀싱을 통해 추가 분석되었습니다. 독소 유전자 기반 PCR은 모든 균주에서 apxI-III 독소 유전자를 강력하게 식별했고, 매우 다양한 apxIV 독소 유전자 패턴을 밝혀냈습니다. 13개의 균주에서는 전 유전체 시퀀싱(WGS)을 통해 cps 유전자 유형 6과 혈청형 2/8/15의 apxIV 독소 유전자 패턴을 확인했습니다. 3개의 혈청형 9/11 균주에서는 cps 유전자 타이핑 실패가 cpsF 유전자의 3' 부위의 결실로 인한 것임을 발견했습니다. 표준화된, 정확한 apx-독소 유전자 패턴과 cps 유전자 기반의 APP 균주 혈청형에 대한 설명이 권장됩니다 (예: APP cps 유형 2, apx 유전자 프로필 apxIB, apxII, apxIII).
Key Points
  • 두 가지 혈청형 분류 방법, 캡슐 유전자 기반과 apx 독소 유전자 기반의 PCR 방법이 151개 APP 필드 균주와 19개 참고 균주를 비교하는 데 사용되었습니다.
  • 전체 필드 균주의 37%는 캡슐 유전자 PCR로 정의된 혈청형과 독소 프로파일이 일치하지 않았으며, 비정형 캡슐 유전자 패턴과 비정형 apxIV 독소 유전자 길이로 분류되었습니다.
  • 전 유전체 시퀀싱을 통해 일부 비정형 APP 균주에서 정확한 cps 유전자 타입 및 apxIV 독소 패턴을 확인하였고, 이는 나머지 균주에 대한 표준화된 apx-독소 유전자 패턴과 cps 유전자 기반 혈청형 설명을 권장하게 되었습니다.