근내지방(IMF) 함량은 육질 평가에 있어 중요한 요소로, 종에 따라 차이가 있으며 주로 근내 지방세포의 수와 크기에 의해 결정됩니다. 그러나 그 잠재적 기전은 아직 충분히 규명되지 않았습니다. 본 연구에서는 라위돼지(LW, 지방형)와 듀록×랜드레이스×요크셔(DLY, 근육형) 돼지의 장늑근(longissimus dorsi)에서 전장 전사체 데이터를 수집하여 심층 분석을 수행했습니다. 종 간 차등 발현 분석을 통해 1,899개의 mRNA, 10개의 마이크로RNA(miRNA), 247개의 서클형 RNA가 확인되었습니다. 차등 발현된 mRNA와 miRNA에 대한 통합 분석을 통해, LW 돼지의 IMF 형성에 잠재적으로 관여하는 두 개의 네트워크 모듈이 도출되었습니다. 첫 번째는 13개의 mRNA(ESR1, COQ3 등)와 하나의 miRNA 유전자(ssc-miR-874)로, 두 번째는 31개의 mRNA(SCML4, PDE7B 등)와 세 개의 miRNA(ssc-miR-125a, ssc-miR-1343, ssc-miR-204)로 구성되어 있습니다. 또한, 13개의 서클형 RNA, 세 개의 miRNA, 31개의 유전자로 구성된 경쟁적 내인성 RNA 네트워크도 구분되어 LW와 DLY 돼지간 IMF 침착의 차등 조절 양상에 관련이 있을 것으로 추정됩니다. SCML4 유전자의 기능은 in vitro에서 3T3-L1 세포주를 사용하여 검증되었고, SCML4가 감소할 때 지방형성과 관련된 주요 단백질(PPARγ, FABP4)의 발현이 유의하게 억제됨이 확인되었습니다. 요약하면, 본 연구는 돼지의 IMF 함량에 대한 경쟁적 내인성 RNA 조절 네트워크를 새롭게 제시하였으며, SCML4가 IMF 형성을 촉진하는 조절 유전자일 가능성을 시사합니다.