조류 파보바이러스 감염은 가금류에서 성장 지연, 체중 감소, 신체 변형 및 폐사율 증가를 유발하여, 가금 산업에 상당한 경제적 손실을 초래할 수 있습니다. 따라서 조류 파보바이러스 감염의 신속하고, 시각적이며, 초고감도 및 고특이도 진단법의 개발이 시기적 적절한 진단 및 효과적인 방제에 필수적입니다. 본 연구에서는 루프 기반 등온 증폭법(LAMP)과 크리스퍼(CRISPR)/CRISPR-연관 단백질 12a(Cas12a) 시스템을 결합한 새로운 검출 플랫폼을 개발하였습니다. 먼저, 아픈 무스코비 오리에서 새로운 조류 파보바이러스 균주를 분리하였으며, 유전체 시퀀싱, 시퀀스 어셈블리 및 계통수 분석을 통해 이 바이러스를 Parvoviridae과, Parvovirinae아과, Dependoparvovirus속에 속하는 아데노-연관 바이러스(AAA)로 확인하였고, 신규 바이러스 균주명을 AAV-2020으로 명명하였습니다. 이어서, AAV-2020의 3개 캡시드 단백질(Cap) 유전자를 타깃으로 한 특이적 sgRNA 및 LAMP 프라이머를 설계 및 최적화하였습니다. 또한, CRISPR/Cas12a 기반 시스템은 AAV-2020에 대해 2 copies/μL 수준의 극미량까지 검출할 수 있어 뛰어난 감도를 보였으며, 높은 염기서열 유사성을 갖는 3종의 근연 AAV 계통과도 효과적으로 구별하여 우수한 특이성을 나타냈습니다. 이처럼, 본 연구에서 개발한 새로운 신속·시각적·초고감도 및 고특이도 AAV-2020 검출 시스템은 조류 파보바이러스 감염의 조기 진단 및 현장 검출의 신뢰성 높은 도구를 제공하며, 가금 산업 내 조류 파보바이러스 감염 방제 및 관리에 크게 기여할 수 있을 것입니다.