배경: 최근 염기서열 분석 기술과 관련 생물정보학 도구의 발전으로 위장관(GIT) 내 숙주 연관 미생물 군집의 다양성에 영향을 미치는 요인 분석이 한층 수월해졌습니다. 지금까지 분변 미생물군에 대한 연구가 활발히 이루어졌지만, 소장은 미생물군, 식이, 숙주 건강 간 상호작용을 이해하는 데 있어 여전히 중요하면서도 상대적으로 덜 탐구된 부위입니다. 본 연구 1에서는 비침습적 샘플링 캡슐인 CapSa를 이용하여 다섯 번의 투여 시점에서 미생물군을 채취하였으며, 증폭 시퀀싱(amplicon sequencing)을 통해 도체기-비육기 돼지의 생애 동안 소장 미생물군 구성이 어떻게 변화하는지 조사하는 것을 목표로 하였습니다. 연구 2는 이유 후 설사를 유발하는 장독소성 대장균(ETEC) F4 감염이 소장 미생물군 역동성에 미치는 장기적 영향을 분석하였습니다. 본 연구는 단기간의 병리적 자극 이후 소장 미생물군의 장기적인 반응에 대한 통찰을 제공한다는 점에서 의의가 있습니다.