돼지 써코바이러스 3형(PCV3)은 전 세계 양돈 산업에 영향을 미치는 다양한 임상 증상과 관련된 주요 병원체로 부각되었습니다. PCV3 균주의 유행과 분자적 특성을 조사하기 위해, 우리는 2022년 3월부터 2024년 12월까지 허난성 18개 도시의 650개 농장에서 다양한 사육 규모의 돼지로부터 총 11,194개의 조직 샘플을 수집했습니다. PCV3 검출은 검증된 실시간 정량 PCR 검사를 사용하여 수행되었습니다. 결과는 PCV3의 총 양성률이 9.25%(1035/11,194)였음을 보여주었고, 허난성 내 18개 도시의 돼지 농장에서 PCV3가 검출되었습니다. 6개의 PCV3 균주의 전체 유전체 서열과 4개의 PCV3 균주 ORF2 유전자 서열이 결정되고 분석되었습니다. 이 10개의 PCV3 균주는 PCV3 참조 균주와 ORF2에서 98%에서 99.7%까지의 뉴클레오타이드 서열 동일성을 공유했습니다. 이 10개의 PCV3 균주의 전체 ORF2 유전자 서열은 상호 간 98.4%에서 99.8%의 뉴클레오타이드 서열 동일성을 가졌으며, 인코딩된 단백질은 98.1%에서 100%의 아미노산 서열 동일성을 가졌습니다. ORF2 유전자를 기준으로 한 계통발생학적 분석은 모든 10개의 서열된 PCV3 균주가 PCV3b 유전형에 속함을 나타내었습니다. 특히, 이들 균주의 Cap 단백질의 예측 B 세포 에피토프에서 두 개의 아미노산 돌연변이가 확인되어 PCV3의 면역원성에 영향을 미칠 수 있습니다. 이러한 데이터는 PCV3의 분자적 역학 및 진화의 이해에 기여하며, PCV3 및 다른 PCVs의 예방 및 통제를 위한 기초를 제공합니다.