비암호화 RNA는 다양한 세포 유형에서 중요한 역할을 합니다. 특히 많은 긴 비암호화 RNA(lincRNA)가 생식 세포 발달에 관련되어 있습니다. 비록 lincRNA는 크게 특성화되지 않았지만, X 비활성화, 전분화성, 유전체 각인, 세포 분화 등을 포함한 주요 생물학적 과정에서 필수적인 역할을 합니다. 본 연구에서는 Gene Expression Omnibus 저장소의 공공적으로 접근 가능한 단일 세포 RNA 시퀀싱 데이터(scRNA-seq)를 이용하여 포괄적인 생정보학적 분석을 수행했습니다. 데이터셋은 돼지 배아발달의 서로 다른 단계에서 얻어진 네 가지 독특한 세포 유형을 포함합니다: E11 유래의 배아외층 세포, E14 유래의 체세포 및 원시 생식 세포, E31 유래의 원시 생식 세포. 우리의 분석은 많은 수의 lincRNA를 식별하고, 그 표현 양식을 평가하여 배아 발달에서의 중요성을 강조했습니다. 우리는 또한 비암호화 RNA와 단백질 암호화 유전자 간의 관계를 탐구하였으며, 특히 초기에 배아 발생 동안 DNA의 메틸화 제거에 중요한 역할을 하는 10-11 전좌(TET) 패밀리 유전자에 중점을 두었습니다. 돼지 초기 배아에서 약 0.15백만 개의 lincRNA 전사체를 확인하였습니다. 또한, 서로 다른 세포 유형 간의 lincRNA와 단백질 암호화 유전자의 차별적 발현 특성을 조사하여, 배아가 분화함에 따라 유전자 발현의 유사성과 차이점을 관찰했습니다. 마지막으로, LncTar를 사용하여 공조표현된 TET 패밀리 유전자와 차별적으로 발현된 lincRNA 사이의 잠재적 상호작용을 예측함으로써 초기 배아 발달에서의 기능적 관계에 대한 추가적인 통찰을 제공했습니다.