다양한 DNA 서열을 인식하는 전사인자의 능력은 결합 특이성을 유지하며 유전자 조절을 위해 필수적입니다. 하지만 이 유연성을 가능하게 하는 분자적 메커니즘은 아직 충분히 이해되지 않았습니다. 본 연구에서는, 전사인자 AflR의 DNA 결합 도메인이 구조화된 아연 클러스터 모티프와 불규칙한 말단 영역을 이용하여 서열 다양한 DNA를 인식하는 방식을 보여줍니다. NMR 분광법, 분자 동역학 시뮬레이션 및 생화학적 접근법을 이용하여, AflR의 DNA 결합 도메인이 동적인 말단 영역에 둘러싸인 구조화된 아연 클러스터 코어를 포함하고 있음을 입증했습니다. AflR의 DNA 결합 도메인 단량체 두 개는 역 CG 하프 사이트를 인식하며, 아연 클러스터 모티프는 서열 특이적 고정 역할을 제공하고, 동적인 말단은 분산된 상호작용을 통해 결합을 최적화합니다. DNA 결합은 전반적인 안정화를 일으키지만, 말단 영역은 결합 상태에서도 유연성을 유지하여 서열 변이에 대한 적응이 가능하게 합니다. 아연 클러스터와 C-말단 잔기의 변이는 복합체의 안정성을 크게 방해합니다. 특히, C-말단 영역은 다양한 표적 서열과의 안정한 복합체 형성에 필요한 구조적 변화를 조정하는 형태적 중심축 역할을 합니다. 본 연구는 전사인자가 특이성을 유지하면서도 서열 다양성을 인식할 수 있도록 하는 내재된 무질서가 어떻게 작용하는지를 보여주며, 다중 표적 유전자 조절의 분자적 기초에 대한 통찰력을 제공합니다.