배경: 장내 미생물 군집은 영양, 생리 및 면역 과정 유지에 필수적이지만, Brachyspira hyodysenteriae (B. hyo)에 의해 발생하는 돼지 이질과 같은 결장 감염은 이러한 항상성을 방해합니다. 본 연구는 B. hyo로 도전 받은 돼지에서 대변, 결장 내용물 및 점막의 샷건 및 전체 길이의 16S rRNA 시퀀싱을 활용하여 관찰된 택사, 기능 및 메타게놈 조립된 유전체(MAG)의 높은 해상도 특징화를 제공하고, 주요 병원체와의 연관성을 공개하며, 감염의 병리학적 변화에 의해 어떻게 영향을 받는지를 탐구합니다.