원료지방 두께(BFT)는 지방 축적과 원료의 지방도를 나타내는 중요한 지표이며, 이는 원료 등급과 가격 책정에 필수적입니다. 통합된 다중 오믹스 방법을 사용하여 BFT와 관련된 유전적 위치와 중요한 유전자를 식별하는 것은 돼지의 유전적 향상에 크게 기여합니다. 이번 연구에서는 418마리의 중국 서회상(蜀淮猪) 돼지를 도축하여 원료지방 두께(BFT)를 측정했습니다. 우리는 SNP 칩 데이터와 전체 유전체 시퀀싱 데이터(iWGS)를 기반으로 한 전장유전체 연관연구(GWAS)를 수행했습니다. 원료지방 두께(BFT)와 관련된 유의한 양적 형질좌위(QTL)는 Sus scrofa 염색체(SSC) 2, SSC4, SSC14에서 확인되었으며, 가장 유의한 단일 뉴클레오타이드 다형성(SNP)은 표현형 변이의 6.58%에서 9.91%를 설명했습니다. 베이지안 정밀 맵핑을 통해 이전에 보고된 두 개의 양적 형질 좌위(QTL)를 확인하고, 가장 세밀한 신뢰 구간을 3 kb(SSC2, 37.337-37.340 Mb 및 SSC4, 75.407-77.006 Mb로 좁혔으며, SSC14, 137.086-138.863 Mb 및 SSC4, 95.237-96.894 Mb와 관련된 두 개의 신규 QTL을 확인했습니다. 더불어 전사체 분석을 통해 지질 및 에너지 대사와 관련된 핵심 조절 경로를 포함한 322개의 차별적으로 발현된 유전자(DEGs)를 확인했습니다. 유전체와 전사체 데이터의 통합은 보통 원료지방 두께(BFT)와 관련된 후보 유전자 세 개(S100A12, XKR4 및 PENK)를 확인했습니다. 전사체 전장 연관 연구(TWAS)와 표현형 전장 연관 연구(PheWAS)는 이 세 유전자가 원료지방 두께(BFT)와 지방산 조성과 유의미하게 연관되어 있음을 추가로 증명했습니다. 이 연구는 돼지 원료지방 두께와 관련된 중요 유전자와 분자 표지자에 대한 새로운 통찰력을 제공합니다.