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4종 돼지 장관 코로나바이러스 검출을 위한 다중 디지털 PCR 검사 확립

2025-09-14 19:01
돼지의 급성 설사 증후군 코로나바이러스(SADS-CoV), 돼지 유행성 설사 바이러스(PEDV), 돼지 델타코로나바이러스(PDCoV), 돼지 전염성 위장염 바이러스(TGEV)를 포함한 돼지 장관 코로나바이러스(CoVs)는 돼지 바이러스성 설사 증후군(VDS)을 유발하는 주요 병원체로, 돼지 산업에 상당한 경제적 손실을 초래하고 있습니다. 임상적으로 유사한 이러한 바이러스를 구분하는 것은 심각한 과제가 되었습니다. 우리는 매우 특이적이며 간섭 저항성을 지닌 돼지 CoV 다중 디지털 PCR(dPCR) 검사를 개발했습니다. 이 검사는 모든 바이러스 농도가 정확한 정량화에 영향을 미치지 않는 강력한 항간섭 능력을 보여주었습니다. 모든 타겟 바이러스에 대한 일괄 내 및 일괄 간 반복성 변동 계수(CV%)는 11% 미만이었습니다. 이 dPCR 검사의 정량화 한계(LoQ)는 각 타겟에 대해 7.5 copies/reaction에 도달하며, qPCR보다 한 단계 더 민감했습니다. SADS-CoV, PEDV, PDCoV 및 TGEV의 검출 한계(LoD)는 각각 2.72, 3.00, 3.56, 3.19 copies/reaction이었습니다. 검증 테스트에서는 총 408개의 알려진 샘플이 사용되었으며 결과는 알려진 조건과 매우 일치하여 97-100%의 일치율을 보여주었습니다. 이 방법의 진단 특이성(Dsp)은 99-100%였습니다. 결론적으로 개발된 다중 dPCR 검사는 4종 돼지 CoVs에 대한 초기 감지 및 격리에 매우 적합합니다. 이 결과는 dPCR 방법이 높은 특이성, 항간섭 능력, 반복성 및 높은 민감도로 특징지어진다는 것을 나타냅니다. 또한 샘플 검출에서 높은 일치율과 진단 특이성을 보여줍니다. 이 다중 dPCR은 돼지 장관 CoV에 의한 VDS의 통제에 기여하고 후속 연구의 단서를 제공할 것입니다.