돼지 써코바이러스 3형(PCV3)은 2016년에 처음 확인되었고 이후 돼지의 생식 장애, 다발성 염증 및 아임상 감염과 연관되어왔습니다. 많은 국가들이 2016년 최초 임상 설명 이전에 PCV3의 존재를 회귀적으로 탐지했습니다. 보고된 PCV3 탐지율은 다양한 공동 감염 돼지에서 6.5%에서 84% 사이로 다양했습니다. 오늘날 PCV3/PCV2 공동 감염은 일반적으로 관찰됩니다. 그러나 2016년 이전에 미국 돼지 산업에서 PCV3 유병률과 PCV2 공동 감염률은 보고되지 않았습니다. 본 연구는 2000년, 2006년, 2012년의 미국 비육돈 농장에서의 혈청 샘플을 사용하여 PCV3 및 PCV3/PCV2 농장 유병률과 지리적 분포를 결정하고, PCV3의 진화 속도 및 선택 압력을 평가하며, Cap 단백질의 구조적 및 형태적 변화를 식별하려고 했습니다. 연구 결과 PCV3가 2016년 최초 설명 이전에 미국 돼지 산업에서 풍토병처럼 존재했다는 것이 밝혀졌습니다. PCV3 농장 유병률은 2000년에 47%에서 2012년에 22%로 감소했습니다. 2000년 농장 수준의 PCV3/PCV2 공동 감염률은 47%였고, 2006년에는 39%였습니다. 2006년 PCV2 백신이 도입된 후, PCV3/PCV2 공동 감염률은 급격히 3%로 감소했으며, 2012년에는 59%의 농장이 PCV3와 PCV2 모두에서 음성으로 나타났습니다. 13개의 PCV3 전체 유전체 서열 중 12개는 PCV3a 참조 균주와 군집을 이루었고 1개는 PCV3c 아형과 군집을 이루었습니다. 28개의 PCV3 ORF2 서열 중에서는 PCV3a1 (1/28), PCV3a2 (4/28), PCV3a3 (19/28), PCV3b (2/28), 및 PCV3c (2/28) 아형이 확인되었습니다. ORF2 뉴클레오타이드 동일성은 97.8%에서 100% 사이였습니다. 2006년에 아미노산 24 및 150에서, 2012년에 아미노산 24 및 27에서 다양한 선택이 발생했습니다. 본 연구에서 식별된 서열과 참조 서열에서 모두 공통적으로 나타난 돌연변이는 A24V와 R27K였습니다. PCV3a2 아형 내에서는 S77T와 I150L 돌연변이가 공통적으로 나타났습니다. F104Y 돌연변이는 추정 T-세포 에피토프 내에 위치해 있고, PCV3c, PCV3b 및 PCV3a3 아형의 서열에 존재했습니다. Cap 분자 모델링 결과, 2012년 서열에서는 아미노산 24 및 27의 구조적 접힘이 알파 나선에서 꼬리 구조로 변경된 것으로 나타났습니다. 따라서, 이 연구는 2000년부터 2012년까지 미국 돼지와 PCV3의 유병률 및 분자 진화에 대한 현재 지식을 넓혔습니다.