돼지 생식기 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 돼지 산업에 막대한 경제적 손실을 초래했지만 효과적인 항바이러스 약물은 없습니다. 뉴클레오캡시드(N) 단백질은 타입 2 PRRSV에서 매우 보존된 단백질로, 항바이러스 개발의 중요한 표적으로 여겨집니다. 미니-바인더는 컴퓨터 기반 접근 방식을 사용하여 특정 단백질 표적을 겨냥해 새롭게 설계된 단백질 약물로, 적용 전망이 큽니다. 여기서 우리는 Rosetta 기반 접근 방식을 이용하여 타입 2 PRRSV의 N 단백질 캡시드 형성 도메인을 목표로 하는 미니-바인더를 설계했습니다. 표적 단백질의 소수성 표면이 결합 부위로 선택되었고, 유망한 결합 모드는 광범위하게 탐색되었습니다. 분자량 약 6 kDa의 세 가지 고도로 내열성을 가진 미니-바인더가 확인되었습니다. 모든 바인더는 세포막을 관통하여 세포질에 분포할 수 있습니다. 이들 중 바인더 2는 시험관 내에서 강력한 항-PRRSV 효능을 발휘하여 바이러스 복제를 강력하게 억제하면서 바이러스의 진입, 내부화, 또는 방출에는 간섭을 일으키지 않았습니다. BLI 분석 및 BiFC 분석을 통해 바인더 2와 PRRSV N 단백질의 캡시드 형성 도메인 간의 결합이 확인되어, 항바이러스 기전이 기대와 일치함을 나타냈습니다. 본 연구는 새로운 항-PRRSV 제제를 개발하는 데 있어 새로운 통찰력을 제공합니다.