이 연구는 항생제 없는 사료 급여 체계에서, 항생제를 프로바이오틱스로 대체하는 과정에서의 정액 품질에 대한 멧돼지 분변 및 정액의 미생물군을 조사하는 것을 목표로 하였습니다. 7마리의 듀록 멧돼지에서 총 21개의 분변 및 21개의 정액 샘플이 3개의 서로 다른 시간대(항생제 제거 전인 0일째, 48일째, 96일째)에서 수집되었습니다. 각각의 시간대에서 신선한 정액의 특성, 세균 배양 내용물, 그리고 멧돼지의 분변 및 정액 미생물군이 분석되었습니다. 수집된 정액은 항생제가 없는 정액 확장액에 희석되어 4일간 저장되었습니다. 저장 기간 동안 매일 정자의 품질과 세균 배양 내용물이 평가되었습니다. 96일째에 정자의 특성인 총 정자 운동성(-17.5 %, P = 0.024), 정자 생존율(-20.4 %, P = 0.002), 그리고 첨체 무결성(-25.8 %, P = 0.002)이 0일째에 비해 유의미하게 낮았습니다. 총 세균 수나 Lactobacillus sp. 수에는 세 시점 간 유의미한 차이가 발견되지 않았습니다(P > 0.05). 그러나 항생제에서 프로바이오틱스로 전환한 이후 신선한 정액에서의 그람 음성 세균의 비율이 0일째 69.5 %에서 96일째 88.0 %로 증가하였습니다. 또한 E. coli의 비율도 0일째 18.7 %에서 96일째 76.0 %로 상승했습니다. 4일간의 저장 기간 동안 총 세균 수와 총 Lactobacillus sp. 수는 증가했습니다(P < 0.05). 정액의 미생물군 분석에서는 정액의 품질이 낮은 멧돼지에서 Enterobacterales (41.4 %)가 주요 세균군으로 나타났고, 품질이 좋은 멧돼지에서는 Bacteroidales (14.2 %)가 주를 이루었습니다. 정액 미생물군의 계통 발생도에서는 항생제에서 프로바이오틱스로 전환한 96일째에 Gammaproteobacteria가 세균 생체지표로 확인되었습니다. 분변 미생물군의 알파 및 베타 다양성에서는 0일째와 96일째 사이에 유의미한 차이가 나타났습니다(P = 0.048). 그러나 정액 미생물군의 알파 및 베타 다양성에서는 유의미한 차이가 없었습니다(P > 0.05). 결론적으로, Gammaproteobacteria, Enterobacterales, 및 E. coli를 포함한 그람 음성 기회성 병원체의 증가는 항생제에서 프로바이오틱스로 전환한 이후 정액 품질 저하와 관련이 있지만, 이는 총 세균 수나 Lactobacillus sp. 수와는 무관합니다. 프로바이오틱 보충은 분변 미생물군의 다양성을 변화시켰으나 정액 미생물군의 다양성이나 정액 품질에는 영향을 미치지 않았으며, 분변과 정액 미생물군 변화 사이에는 연결이 없었습니다.