인플루엔자 A 바이러스(IAV)는 돼지에서 가장 자주 발견되는 호흡기 병원체 중 하나입니다. 미국의 수동 감시 시스템은 유전적 다양성의 공간적 및 시간적 변화를 정량화하기 위한 집계된 메트릭을 제공합니다. 그러나 돼지 생산은 균일하지 않으며, 생산 시스템은 크기와 관리 전략에서 차이가 있으며 이는 IAV의 전파 및 진화에 영향을 줍니다. 세세한 차이가 IAV 전파에 어떻게 영향을 미치는지 평가하기 위해, 우리는 14개월 동안 4개의 미국 생산 체계에서 자돈 농장과 연결된 번식농장에 대한 적극적인 감시를 수행했습니다. 85개의 완전 HA 서열과 연관역학 정보를 포함한 62개의 전장 게놈이 생성되었습니다. 우리는 계통동력학 분석을 수행하여 4개의 HA 계통인 H1 1A 고전적 돼지, H1 1B 인체-계절적, 그리고 H3 2010.1 및 1990.4에서 6개의 유전적 계통을 발견했습니다. H1 1B 및 H3 1990.4는 번식농장에서 자돈까지의 전파 증거를 보였습니다. H1 1A와 H3 2010.1 바이러스는 연결된 번식농장 감지 없이 자돈에서 감지되었습니다. H1N1 팬데믹 계통(1A.3.3.2)에서 번식농장과 자돈 장소에서 7번의 개별적인 사람-돼지 전파 사건이 확인되었습니다. 자돈 장소는 번식농장과 연결된 IAV뿐만 아니라 연결되지 않은 IAV와도 감염되었습니다. 번식 축군 내의 아임상적 IAV 전파, 자돈 농장에서의 번식농장 원천 혼합, 새로운 계통의 지역적 확산 및 사람-돼지 전파로 인해 통제 노력에 영향을 받을 수 있습니다. 생산 시스템 내의 정기적인 감시 활동은 백신 구성 요소를 순환하는 다양성에 맞추어 새로운 재조합 바이러스가 출현하여 동물 건강에 영향을 미칠 기회를 최소화할 수 있습니다.