이 체계적 검토의 목적은 돼지 폐수 처리 시스템에서 항생제 내성 유전자(ARG)의 검출을 위해 사용되는 메타게놈 방법론적 접근법을 식별하는 것입니다. 사용된 검색어는 메타게놈 AND 박테리아 AND ("항생제 내성 유전자" OR 저항유전체 OR ARG) AND 폐수 AND (돼지 OR 돼지)이며, 검색은 다음의 전자 데이터베이스에서 수행되었습니다: PubMed, Scopus, ScienceDirect, Web of Science, Embase, Cochrane Library. 검색은 2020년부터 2024년 사이에 출판된 연구로 제한되었습니다. 검색된 220개의 연구 중 8개가 전문 분석을 위한 적격 기준에 부합하였습니다. 이 연구 분야의 출판물은 최근 몇 년 동안 증가하고 있으며, 중국이 가장 많은 연구를 기여하고 있습니다. ARG는 품질 절단, 조립, 메타게놈 조립된 게놈(MAG) 재구성, 개방 읽기 틀(ORF) 예측 및 ARG 주석과 같은 단계를 포함하는 생정보학 파이프라인을 사용하여 일반적으로 식별됩니다. 그러나 연구 간에 ARG 정량화 방법을 비교하는 것은 방법론적 차이와 정량화 접근의 다양성 때문에 여전히 어려운 문제입니다. 따라서 이 체계적 검토는 돼지 폐수 처리 시스템에서의 항생제 내성에 대한 이해를 촉진하고, 이를 메타게놈 접근법을 통해 비교하고 이해를 증진하기 위해 방법론적 표준화의 필요성을 강조합니다.