아프리카돼지열병(ASF)은 전 세계 가정 돼지에 영향을 미치는 매우 전염성이 강한 경계 간 바이러스 질환으로, 효과적인 백신이 없어 거의 100%의 치사율을 보입니다. 그러나 멧돼지(Phacochoerus sp.)와 부시돼지(Potamochoerus sp.)와 같은 야생 종은 임상 증상을 보이지 않으며, 이전 연구에서는 멧돼지에서 발견된 NF-κB의 하위 유닛인 원발암 유전자 RelA의 아미노산 치환이 저항성의 원인일 수 있다고 제시했습니다. ASFV 양성 사례에 대한 정보가 부족하여 내성이 있다고 여겨지던 인도 품종 Doom을 대상으로 이러한 내성의 유전적 기초를 식별하여 내성 품종을 만들어 질병의 확산을 막을 수 있는 방안을 마련하기 위해 이 연구가 시작되었습니다. 이 연구는 Doom 품종의 RelA 유전자에 warthogs와 유사한 변형된 서명을 연구하기 위해 시작되었습니다. 초기 분자 도킹 연구에서는 돼지 RELA의 Rel 유사 도메인 N-말단 서브도메인과 아프리카돼지열병 바이러스(ASFV) 단백질 A238L(기능이 알려지지 않은 가상의 바이러스 단백질) 간의 잠재적 상호작용이 확인되었습니다. 이 아미노산 상호작용은 돼지 RelA 유전자의 엑손 10의 뉴클레오타이드 서열에 해당합니다. 나아가 ARMS-PCR(증폭 저항성 변이 체계 PCR)과 PCR-RFLP(제한 절편 길이 다형성)가 Ensemble 게놈 브라우저를 통해 엑손 10 영역에서 식별된 단일 뉴클레오타이드 다형성(SNP, CCT/GCT: Pro→Ala)을 타깃으로 최적화되었습니다. PCR 결과는 Doom을 포함하여 테스트된 모든 돼지 품종에서 프롤린을 코딩하는 호모지형 CC 유전형의 존재를 보여주었습니다. Sanger 시퀀싱은 모든 품종에서 CC 유전형을 확인하여 Doom에서 이 RELA 도메인의 아미노산 치환이 존재하지 않으며 ASF 내성의 원인이 아닐 수도 있음을 나타냈습니다. 질병 내성은 다유전자 형질이기 때문에 하나의 유전자에 의존하는 것으로는 ASFV에 대한 내성의 정확한 원인을 밝히기 어려울 수 있습니다. 향후 연구는 선천적 면역 경로에 중요한 역할을 하는 다른 유전자 세트를 대상으로 하거나 Genomic Wide Association Study를 통해 Doom의 ASFV에 대한 내성과 관련된 SNP를 식별하고 연관 짓는 데 초점을 맞출 수 있습니다.