돼지 생식기 호흡기 증후군(PRRS)은 상당한 경제적 손실을 초래하며 돼지 산업의 주요 과제입니다. PRRS 바이러스(PRRSV)는 높은 돌연변이와 진화 속도를 보입니다. 우리는 변형 생백신(MLV) 바이러스(계통 5 RFLP 2-5-2)와 야생형(WT) PRRSV 바이러스(계통 1A RFLP 1-7-4)의 다양한 농도가 동일한 샘플에 존재할 때 ORF5 Sanger 서열 분석 결과에 미치는 영향을 조사했습니다. 생백신 바이러스가 야생형 바이러스와 같은 수준 또는 더 높은 농도로 존재할 때, 백신과 유사한 서열은 야생형 바이러스보다 더 자주 검출되었습니다. 이 결과는 ORF5 Sanger 서열 분석이 둘 이상의 바이러스를 포함하는 샘플에서 지배적인 바이러스를 우선적으로 검출하여 백신 접종된 무리에서 야생형 바이러스 감염을 잠재적으로 가려버릴 수 있음을 시사합니다. 우리의 발견이 단일 샘플 내의 균주 병존 확인의 제한점을 강조하지만, Sanger 서열 분석은 여전히 PRRSV를 특성화하는 데 널리 사용되는 접근 가능한 도구입니다. NGS 또는 CLAMP 기반 접근법과 같은 고급 서열 분석 기술은 Sanger 서열 분석 결과를 보완하여 합의 서열 편향을 최소화하고 백신과 유사한 서열을 선택적으로 차단함으로써 병존 변종의 검출을 향상시킬 수 있습니다.