돼지 이질은 혐기성 나선균인 Bracyspira hyodysenteriae에 의해 발생하며, 비육기 돼지에서 점막출혈성 설사를 유발하여 돼지 생산에 영향을 미칩니다. 이 질병의 유전체 역학에 대한 지식은 제한적입니다. 우리는 이 연구에서 117개의 분리균주를 포함하여 10개국에서 온 251개의 B. hyodysenteriae 유전체에 대한 전체 유전체 서열 분석을 수행했습니다. 핵심 유전체 단일 뉴클레오타이드 다형성(SNP)에 기초한 계통유전체 분석은 9개의 계통을 밝혀내었으며, L7 (72개 분리균주, 28.69%), L9 (67개 분리균주, 26.69%), L2 (53개 분리균주, 21.12%)가 우세했습니다. 지역적 군집화는 뚜렷한 계통 분포와 함께 관찰되었습니다. 다좌위 서열 유형화는 69개의 서열 유형(ST)을 식별했으며, 251개의 유전체 중 20개의 새로운 ST를 포함하고 있습니다. 특정 계통, ST 및 지리적 지역 간의 연관성이 명백하게 드러나, 진화적 및 지역적 패턴을 강조합니다. 팬유전체 분석은 핵심(1,648개), 부가(2,619개), 유일(964개) 구성 요소로 분류된 5,231개의 유전자를 확인했습니다. 기능적 주석은 핵심 유전자가 필수 세포 프로세스와 연결되었으며, 부가 및 유일 유전자는 유전적 다양성, 방어 메커니즘 및 이차 대사에 풍부하게 나타났습니다. 팬유전체는 가설적인 유전자가 높은 비율을 차지하여 추가적인 기능적 특성이 필요함을 시사합니다. 항생제 내성(AMR) 스크리닝은 특정 계통과 ST에서 티아물린과 린코마이신 내성과 관련된 tva(A)와 lnu(C) 유전자를 발견했습니다. 독성 인자 분석은 대부분의 분리균주에서 용혈소 생성, 철 흡수, 숙주 환경 내 생존과 연결된 유전자를 확인했으며, 계통 특정 연관성이 있는 유전자 하위 집합이 병원성 잠재력과 연결됨을 시사합니다. 이 종합적 유전체 역학 분석은 전세계 B. hyodysenteriae의 유전적 다양성, 항생제 내성 및 독성을 설명하며, 이질의 역학 이해를 높이고 돼지 이질을 완화하기 위한 개입을 안내합니다.