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GCRP: 11,951개의 닭 게놈으로 구성된 통합 글로벌 닭 참조 패널

2025-04-16 19:01 | 추천 : 0 | 댓글 : 0
닭은 인간에게 중요한 단백질 공급원이며 조류 연구에 인기 있는 모델 동물입니다. 대규모 집단을 대상으로 한 신뢰할 수 있는 유전자형 전략으로서의 유전자 보강 기술의 발전에도 불구하고, 고품질 닭 참조 패널의 부족은 닭 게놈 연구의 진전을 저해해왔습니다. 이를 해결하기 위해, 우리는 첫 번째 100K 글로벌 닭 참조 패널(100KGCRP)의 첫 번째 단계를 소개합니다. 현재 두 개의 패널이 제공되고 있으며, 이는 가축화 다양성 연구를 위한 포괄적 조화 패널(CMP)과 육계 번식을 위한 상업적 품종 패널(CBP)입니다. 유전자형 보강 품질 평가 결과, 기존의 Animal-SNPAtlas 및 Animal Genotype Imputation Database(AGIDB)를 사용한 보강과 비교하여 CMP가 가장 높은 보강 정확성을 보였으며, CBP는 상업적 집단의 보강에서 안정적인 성과를 보였습니다. 또한, GCRP 보강 데이터를 사용하는 전장 유전자 연관 연구는 시뮬레이션된 혹은 실제 형질에서 더 높은 통계적 힘을 보였습니다. 결론적으로, 우리의 연구는 GCRP가 닭을 위한 고품질 참조 패널의 공백을 효과적으로 채우고 있음을 나타내며, 향후 유전 및 번식 연구를 위한 효과적인 보강 플랫폼을 제공합니다. 본 프로젝트는 11,951개의 샘플을 포함하며 다양한 응용 프로그램을 위한 서비스를 웹사이트(http://farmrefpanel.com/GCRP/#/)에서 제공합니다.