호주 퀸즐랜드에 위치한 한 돼지 도축장의 폐수 처리 시스템이 6개월에 걸쳐 모니터링되어, 관개 재이용 전 바이러스 제거를 위한 연못 기반 처리 시스템의 효율성이 평가되었습니다. 본 연구에서는 네 종류의 바이러스를 시설 내 유입 지점부터 최종 처리 방류수까지 추적하여, 주요 바이러스 오염원의 위치를 파악하고 각 처리 단계별 바이러스 감소 효과를 정량적으로 분석하였습니다. 트럭 세척 구역은 돼지 분변물의 운송차량 내 축적과 세척 시 방출로 인해 전반적으로 가장 높은 바이러스 부하를 보였습니다. 대기장과 도축장 또한 바이러스 부하가 상당히 높게 나타났는데, 이는 살아있는 동물과의 직접 접촉 및 도체 처리 과정과 일치하는 결과입니다. 반면, 본잉룸은 시료 채취 위치 중 가장 낮은 바이러스 부하가 관찰되었습니다. 이러한 결과는 표적 위생 관리 및 배수관리에 우선적으로 개입해야 할 핵심 구역을 도출하는 데 기여하였습니다. 3단계 연못 시스템(혐기성, 호기성, 저장 연못)은 각 단계별로 바이러스 농도가 지속적으로 감소하며, 최종 연못 단계에서는 바이러스 농도가 대개 검출 한계 이하에 도달했습니다. 전체 바이러스 감소율은 바이러스 종류에 따라 약 90%~99.9%의 범위를 보였습니다. 관개 지역의 토양 시료에서 모든 바이러스가 음성으로 확인되어, 살수된 처리수 내 바이러스가 검출되지 않은 결과와 일치하며, 본 연구 조건 하에서 토양에 바이러스 잔존이 없음을 시사합니다. 바이러스 생존여부를 반영한 정량적 중합효소연쇄반응(qPCR) 및 역전사 실시간 정량중합효소연쇄반응(RT-qPCR) 분석 결과, 처리된 폐수 내에서 검출된 바이러스 유전체 대부분은 완전한 구조를 갖추지 못한, 감염력이 거의 없는 바이러스 입자로부터 기인한 것으로 나타났습니다. 처리 마지막 단계 이후에도 바이러스 유전체가 측정 가능한 경우가 있었으나, 감염성 입자의 검출은 극히 드물어, 전통적 qPCR/RT-qPCR 단독 계측이 실제 감염성 바이러스 존재를 과대평가할 수 있음을 시사합니다. 전반적으로, 본 연못 기반 폐수 처리 시스템은 관개 재이용 전에 효과적으로 바이러스를 제거하였으며, 처리 효율 유지를 위해 적정 체류시간 확보가 권장됩니다. 아울러 트럭 세척수의 전략적 관리는 바이러스 부하를 추가로 저감할 수 있는 기회로 확인되었습니다.