배경/목적: 돼지 써큘로바이러스 2형(PCV2)은 경제적 손실과 생산성 저하와 연관된 질병의 주요 원인 바이러스로서 전 세계 양돈 산업에 지속적으로 영향을 미치고 있습니다. 현재까지 아홉 가지 유전형(PCV2a–PCV2i)이 보고되었으며, 유전형의 전환 추세는 과거 PCV2a의 우세, PCV2b의 확산, 최근 PCV2d의 등장 및 여러 양돈국에서의 우점 현상으로 특징지어집니다. 본 연구의 목적은 멕시코 할리스코 지역에서 유통 중인 PCV2의 ORF2 유전자를 특성화하여, 해당 지역의 최신 모니터링 및 방제 전략 수립에 기초자료를 제공하는 데 있습니다. 방법: 돼지 사육 밀도 및 생산체계가 서로 다른 할리스코 내 4개 지역의 80개 농장에서 샘플을 수집하였습니다. PCV2 양성 샘플에 대해 ORF2 유전자 증폭 및 염기서열 분석을 수행하였고, 유전형 판별, 계통수 분석, 그리고 여러 방식의 인실리코 재조합 스크리닝을 실시하였습니다. 모든 염기서열은 GenBank에 등록하였습니다. 결과: 총 70개의 ORF2-PCV2 염기서열이 확보되었으며, PCV2d(51/70, 72.9%)와 PCV2a(19/70, 27.1%) 두 유전형으로 분류되었습니다. 이들 염기서열은 GenBank에 PV235521~PV235590 등록번호로 등재되었습니다. 재조합 분석에서는 7개의 재조합 염기서열이 확인되었고, 일부에서 비정상적으로 연장된 ORF2가 나타나 지역 내 유전적 변이체가 순환 중임을 시사하였습니다. 결론: 본 연구는 할리스코 지역에서 PCV2d 유전형의 우점성을 확인함과 동시에 PCV2a의 지속적 순환을 부각합니다. 두 유전형의 공존과 재조합 염기서열, 그리고 ORF2의 비정상적 연장 등은 해당 지역에서 PCV2가 계속해서 유전적으로 다변화되고 있음을 보여줍니다. 바이러스의 진화 모니터링, 유전형 기반 방제전략 수립, 그리고 양돈 건강관리 강화를 위해 지속적인 분자감시가 필수적입니다.