외부 발효 침대(EFB)는 동물 폐기물을 재활용하기 위해 사용되지만, 항생제 내성 유전자(ARGs)와 소독제 또는 중금속 내성 유전자(B/MRGs), 병원균의 운명과 역동적 변화는 명확하지 않습니다. 우리는 돼지 배설물의 내성체와 박테리아 군집을 연구하기 위해 24개의 농장에서 수집한 돼지 배설물 샘플 129개와 5개 농장의 EFB에서의 프로필과 154일간 한 농장의 EFB를 모니터링하였습니다. 결과적으로, 다른 도시(청두, 메이산, 충칭)에서 나온 돼지 배설물은 311개의 ARG 아형 중 284개를 공유하고 있으며, 이 중 70% 이상이 고위험 ARG이고, 114개의 병원성 박테리아 중 106개를 보유하고 있었습니다. 돼지 농장은 특히 Escherichia coli와 Streptococcus suis가 다제내성 ARG의 숙주인 상태로, 고위험 ARGs, B/MRGs, 그리고 병원성 숙주와의 공존으로 인해 심각하게 오염된 상태였습니다. EFB의 적용은 배설물에서 이 위험을 현저히 완화시켰으며, 고위험 ARGs는 3.09배 감소, B/MRGs는 72.22% 감소, 우선 병원균은 3.95배 감소, 돼지 병원균의 상대적 존재량은 89.09% 감소, 그리고 이들의 상관 네트워크와 공존 패턴이 단순화되었습니다. 맨텔 분석에서는 금속 함량(Fe, Mn, Cu)과 시간이 병원균 및 ARG 프로필에 영향을 미친다는 것을 밝혔습니다. 병원체, ARGs 및 위험 ARGs는 주기적인 변화를 보였으며, 14일, 84일, 154일에 최고조에 달했으며, 70일 간격이 존재했습니다. 이 연구는 돼지 배설물과 EFBs와 관련된 위험에 대한 포괄적인 평가를 제공하며, EFB가 B/MRGs와 병원균과의 연관성을 억제하여 ARG 위험을 줄인다는 것을 입증합니다. 이 발견은 EFB 적용에서의 항균제 저항과 병원성 오염물질 관리 개선에 도움을 주고 환경 오염을 줄이는 가이드로 활용될 수 있습니다.