단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)은 개별 세포 수준에서 전체 전사체 유전자 발현을 연구할 수 있는 능력 덕분에 세포의 정체성과 기능에 대한 이해를 혁신적으로 변화시켰습니다. 여러 조직에서 얻어진 scRNA-seq 아틀라스는 전신적인 세포 역학에 대한 총체적인 이해를 제공하며, 다양한 종에서 추가적인 과학 연구를 위한 핵심 기초 자료로 활용되고 있습니다. 돼지는 귀중한 의생명 모델이며, 돼지고기는 세계적으로 필수적인 식량원이지만, 해부학적 위치에 따른 면역세포의 정체성과 기능에 대한 이해가 미흡해 양돈 산업 및 보건 분야의 발전에 한계가 있습니다. 이러한 한계를 극복하기 위해, 본 연구에서는 scRNA-seq을 활용하여 주요 면역 조직(골수와 흉선) 및 이차 림프기관(림프절과 비장)에서 분리된 면역세포의 지도를 작성하였습니다. 흉선 데이터는 과거에 발표된 돼지 흉선 scRNA-seq 데이터셋과 비교하였으며, 전반적으로 유사성과 더불어 새로운 흉선 세포 군집도 몇 가지 추가적으로 확인되었습니다. 또한 비장 세포는 인체 비장 scRNA-seq 데이터셋과의 비교를 통해, 돼지와 사람 모두에서 보존된 두 가지 선천성 림프구 아형 등 여러 보존적 특징이 밝혀졌습니다. 림프절 scRNA-seq 데이터를 통한 세포 상호작용 및 근접 관계 추론에서는 일부 여포 구조 및 전통적인 생식 중심 반응 과정의 특징이 유사하게 관찰되었습니다. 앞으로 이 scRNA-seq 아틀라스의 접근성을 높이기 위해, 다양한 골수 유래 세포 집단을 비전산 전문가도 쉽게 탐색할 수 있도록 대화형 어플리케이션을 개발하여 그 활용 사례도 제시하였습니다. 본 연구 결과는 돼지 림프기관 내 면역세포의 정체성과 기능에 대한 기초적 이해를 확장하고, 향후 연구에서 돼지-인간 면역 유사점까지 고려할 것을 시사합니다. 이 연구의 관련 자료는 돼지 면역과 관련한 기초적 지식을 필요로 하는 개별 연구자들도 쉽게 활용할 수 있도록 공개되었습니다.