고균수 및 높은 항생제 선택압이 특징인 돼지 폐수는 다양한 박테리오파지의 독특한 저수지 역할을 합니다. 본 연구에서는 단일 돼지 폐수 샘플에서 두 종의 신규 박테리오파지(vB_EcoM_BYEP01 및 vB_SalS_SP14)를 동시에 분리 및 규명하였습니다. 이들 파지는 각각 원래의 숙주 균주인 Escherichia coli BYEC01 및 Salmonella enterica ATCC 14028을 특이적으로 표적합니다. 두 파지 모두 30~50°C의 온도 범위에서 활성을 보이며, pH 6~10의 범위에서도 안정적으로 유지됩니다. 투과전자현미경 관찰 결과 vB_EcoM_BYEP01은 Myoviridae 계열, vB_SalS_SP14는 Microviridae 계열에 속함이 확인되었습니다. 전체 유전체 염기서열 분석 및 비교 연구에서도 이러한 계통학적 차이가 추가로 입증되었습니다. 주목할 점은, 이러한 구조적 및 유전체학적 차이에도 불구하고, 두 파지 모두 효율적인 용균 생활사를 나타낸다는 것입니다. 독소 또는 항생제 내성과 관련된 유전자가 존재하지 않아 생물학적 안전성 또한 입증되었습니다. 공통적으로 높은 흡착 속도, 짧은 잠복기, 대규모 폭발적인 증식이라는 핵심 기능적 특징을 공유하며, 강력한 세균 사멸 능력을 강조합니다. 두 박테리오파지는 항생제와 병용할 경우 항균 활성을 증진시키고, 식품(우유 및 돼지 피부)과 마우스 감염 모델에서 보호 효과를 입증하였습니다. 이처럼 구조적으로 무관하지만 고효율을 나타내는 박테리오파지들이 단일 미세환경에 공존한다는 사실은 박테리오파지의 본질적인 기능적 중첩성과 진화적 적응성을 보여줍니다. 본 연구는 다양한 세균성 병원체를 겨냥한 맞춤형 파지 칵테일 치료제 개발에 유의미한 통찰을 제공합니다.